自动化学院前身是自动化系，于2000年7月成立，2008年更名为自动化学院。设有自动化系、测控技术与仪器系、探测制导与控制技术系和自动化学院实验中心。现有教职员工54人，专任教师40人，教授11人，博士生导师6人，硕士生导师28人，拥有教育部高等学校自动化类专业教指委委员1人，辽宁省特聘教授1人，辽宁省优秀专家1人，辽宁省教学名师1人，辽宁省百千万人才工程“百层次”获得者3人，“千层次”3人，“万层次”8人，辽宁省“兴辽英才计划”青年拔尖人才3人。
学院有“自动化”“测控技术与仪器”“探测制导与控制技术”三个本科专业，皆为辽宁省普通高校一流本科教育示范专业，其中，“自动化”“测控技术与仪器”为国家级一流本科专业建设点，“探测制导与控制技术”专业为教育部第三批“卓越工程师教育培养计划”试点专业；“自动化”“测控技术与仪器”“探测制导与控制技术”专业都已通过中国工程教育专业认证；“测控技术与仪器”专业为辽宁省创新创业教育改革试点专业。学院与中航工业沈飞建立了国家级校外实践基地，分别与中国航发黎明和北部战区航空中心修理厂建立了省级校外实践基地。
学院有“航空机械检测及控制”二级学科博士点、“控制科学与工程”一级学科学术硕士学位和“电子信息（控制工程）”专业硕士学位授予权。“控制科学与工程”学科于2006年建成“模式识别与智能系统”二级硕士点，2008年获批辽宁省教育厅重点培育学科，连续三次获辽宁省“提升高等学校核心竞争力特色学科”立项，2011年同时建成一级学科及专业学位硕士点，2016年获批“检测技术与自动化装置”国防特色学科。建有“辽宁省飞行器测试与控制技术重点实验室”“辽宁省先进飞行控制与仿真技术重点实验室”和“沈阳市飞行器控制与仿真技术重点实验室”3个省部级科研平台。
近五年，学院承担科研项目214项，其中国家级23项；科研经费总额10361.95万元；发表学术论文529篇，其中SCI/EI检索257篇；授权发明专利65项；师生国际学术交流20余人次，出访包括美国、英国、法国、荷兰、加拿大、日本和澳大利亚等国家的学术机构；获省部级科技奖10项，其中省部级一等奖2项，二等奖5项；获省部级及以上教学成果奖6项；举办了中国航空大会、全国自动化教育学术年会、航空总师论坛等学术会议。学科与中航工业沈飞、中国航发黎明、中航工业601所等20余家军工单位建立了紧密的合作关系，在辽宁省电子信息产业校企联盟建设中发挥了骨干作用。
学院有飞行器导航、制导与控制实验室，工业控制实验室，过程控制实验室，智能仪器实验室，虚拟仪器实验室，传感与检测技术实验室，自动控制技术实验室，电机拖动与自动控制系统实验室，现代控制技术实验室，大学生创新实验室，既能培养大学生的实践应用能力，又能满足学生的创新学习需求。
学院学术氛围浓厚、教风严谨、学风踏实，在各项教学环节中以培养高水平应用型人才为目标，注重理论与实际联系，注重强电与弱电结合，注意硬件与软件并重。学院非常重视大学生创新和科技活动，先后承办和参与多项大学生创新竞赛活动，取得了丰硕成果。近五年，大学生课外科技竞赛共获得国家级奖项40余项，省部级奖项200余项，学生参与各级各类科技活动比例达到100%；考研上线率逐年提升，考研录取率稳定在33％左右；坚持以工程认证体系为坐标，以用人单位需求为导向，搭建校企沟通合作桥梁，近五年年终就业率均达到95％以上。
自动化专业
专业成立于2000年，立足区域经济，服务国防科技工业发展，旨在培养德智体美劳全面发展的社会主义事业建设者和接班人，能在工业自动化、航空航天、电子信息、智能制造等领域内从事控制相关的系统运行和维护、工程设计与实施、技术开发与服务、生产运营与管理等工作，理想信念坚定、基础扎实、发展能力好的高水平应用型人才。本专业已通过中国工程教育认证，是国家级一流本科专业建设点，辽宁省普通高校一流本科教育示范专业。
专业以“发扬传统优势，发展航空特色”为指导思想，逐步完善飞行器控制、现代控制技术等本科实验室，组织学生积极参加大创项目、科技竞赛等，实现创新创业教育四年不断线。毕业生学业成绩优秀，考研录取率高，且学习能力强，在企事业单位表现优异，被评价为“踏实、务实、忠实”。
测控技术与仪器专业
专业成立于2000年，立足辽宁、融入地方、服务国防，面向辽宁省区域经济建设和国防建设，培养具有坚实的专业技术基础，能在航空航天、电子信息、智能制造等相关领域从事测量、控制和仪器仪表系统设计研发、技术支持、运营管理等工作，具有较强的工程实践能力和创新意识，综合素质高，有良好发展能力的高水平应用型工程技术人才。本专业已通过中国工程教育认证，是国家级一流本科专业建设点，辽宁省普通高校一流本科教育示范专业，辽宁省创新创业改革试点专业。
专业以“质量求生存，特色促发展”为指导思想，坚持航空特色鲜明，科研反哺教学的道路。专业重视实践能力培养，国防特色突出。近3年专业毕业生就业率近100%，考研率近30%，毕业生基础扎实，踏实肯干，适应能力强，受到用人单位好评。
探测制导与控制技术专业
专业成立于2007年，面向航空航天产业、国防科技工业和辽沈区域经济，培养具有良好综合素养，系统掌握电子技术、控制理论、飞行器探测、制导与控制专业知识，软硬件基本方法与技能，能够在导航制导、飞行器探测、工业控制等相关领域内从事研究、设计、开发、应用、维护和管理等工作，有良好发展能力的高水平应用型人才。本专业已通过中国工程教育认证，是教育部第三批“卓越工程师教育培养计划”试点专业，辽宁省普通高校一流本科教育示范专业。
专业以“立足航空航天、适应民用工程”为指导思想，推行“3+1”工程人才方案，根据工程认证培养标准，形成跨学科、模块式、梯进式的人才培养模式，航空航天特色明显。面向新工科，结合辽宁产业基础，积极推进具有专业特色的卓越工程师人才培养模式，毕业生受到用人单位广泛欢迎。
